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南农大完成植物重复基因数据库

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发表于 2019-3-14 11:47:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
  新华社南京3月3日电(记者陈席元)记者不日从南京农业大学领会到,该校张绍铃老师团队编制判决了梨等141种植物基因组的区别类型反复基因,构修了植物反复基因数据库,揭示了反复基因进化的普通秩序。合系效率不日正在线揭晓于邦际出名学术期刊《基因组生物学》,论坛数据库也正在南农大官网供邦外里探究者共享。
  据论文第一作家、南京农业大学园艺学院博士生乔鑫先容,反复基因即基因复制发作的两个同源基因,植物通过复制基因,可能足够本身基因库,抵御外界杂乱众变的情况,还能增添进化变异的机遇,杀青物种分解和众样性。
  跟着近年来测序手艺的升级,测序本钱大幅低重,越来越众的植物基因组被破译,目前已竣工全基因组测序的植物横跨200种,包罗单细胞绿藻、苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物以及被子植物,但对付判决区别品种植物的反复基因,仍缺乏一个通用本事。
  南农大张绍铃老师团队此前编制判决了梨基因组中的反复基因,以此为根底,团队开采了一个具有普通实用性的生物音信学本事,并深远分解了141种植物的基因组。
  探究结果标明,正在植物漫长的进化经过中,基因串联复制和左近复制永远依旧较高的爆发频率,为植物合适杂乱众变的外界情况供应源源不竭的遗传变异资料。正在基因组加倍后的较短光阴内,反复基因间会爆发高频率的基因置换,并跟着光阴推移进一步分解。
  张绍铃呈现,团队诈骗141种植物基因组中包括的一切卵白序列,构修了大周围的植物直系同源基因家族,包括大豆、水稻、小麦、玉米等大宗粮食作物,以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花草等园艺作物,从此将络续拓展其他植物种别。
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